В моём складе сейчас Торг предложения выгружены как отдельные товары. А не как модификации основного. получилось так http://joxi.ru/JMAj4nxFJe41me - будет путанница.
в битриксе реализовано через систему SKU - у товара может быть много модификаций http://joxi.ru/752a7WLfRKWMr0 то же самое хочу и от моего склада.

Как примерно вижу это реализовать:
выгрузить из магазина все товары в мой склад с ценами, модификациями и вкл синхронизацию. в последствии все товары создавать в моём складе сначала чтобы они выгружались на сайт. И на сайте уже дополнять товары картинками свойствами описанием и тп.