После переноса документов из УТ 10.3 в 11.4 возникла проблема: в документах Реализация товаров и услуг, которые содержали несколько строк с одним артикулом - эти строки отвязались от документа Заказ клиента и Заказы не закрываются.
Вариант решения, указанный ниже - проверил на нескольких документах, изменяя реквизиты через обработку Групповое изменение реквизитов. Если есть более элегантное решение - предлагайте.

1. Отобрать документы Реализация товаров и услуг, где есть строки не привязанные к документу Заказ клиента.
2. Заполнить в табличной части документа Реализация товаров и услуг отсутствующий реквизит Код строки из документа Заказа клиента, сопоставляя строки по артикулу.
3. Перепровести документ Реализация товаров и услуг.
4. В связанном документе Заказ клиента, если он отгружен на 100% - в строках, где реквизит Вариант обеспечения = К обеспечению, поменять на реквизит Отгрузить.
3. Перепровести документ Заказ клиента.