Есть VPS-сервер на котором крутятся 3 интернет-магазина с небольшим трафиком, до 5000/сутки.

Конфигурация:
3Gb/4xXeon E5-2630/SSD
CentOS 64bit, mysql, php, apache, memcached

Проблемы:
- низкая отзывчивость сайта (отдача страниц)
- неадекватная загрузка CPU при минимальном трафике (апач/мускул)

Что нужно:
Нужно разобраться в чем проблема и устранить узкие места.
Провести общий аудит системы

варианты всё снести и переустановить с нуля не рассматриваются.
тяжелые sql запросы оптизированы/закэшированы.
картинки/css/js вынесены на внешний cdn.